بقعه سید اسماعیل از بقعه های متعلق به دوره قاجاریه است که بنای امروزی آن از دوره محمد شاه به جا مانده است. کتیبه و ایوان و رواق حرم مربوط به دوره قاجار است. در قسمت بالای مرقد سید ، درب منبت کاری شده ای وجود دارد که روی این درب، کتیبه زیبایی وجود دارد. کتیبه های دیگری نیز به خط نسخ برجسته، بالای درب وجود دارد که تاریخ آن جمادی الاول سال 886 هجری قمری است (زمان آق قویونلو) که ظاهرا قدیمی ترین تاریخی است که در بناهای کهنه تهران دیده مى شود.